Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms