Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9E0

Slc22a17, Solute carrier family 22 member 17, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a17Q9D9E0 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc22a17Q9D9E0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms