Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Gtf3c6Q9D8P7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Gtf3c6Q9D8P7 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Gtf3c6Q9D8P7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Gtf3c6Q9D8P7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Gtf3c6Q9D8P7 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Gtf3c6Q9D8P7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Gtf3c6Q9D8P7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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