Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl4Q9D8E6 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms