Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chmp4bQ9D8B3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chmp4bQ9D8B3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chmp4bQ9D8B3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chmp4bQ9D8B3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chmp4bQ9D8B3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chmp4bQ9D8B3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chmp4bQ9D8B3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chmp4bQ9D8B3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chmp4bQ9D8B3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chmp4bQ9D8B3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chmp4bQ9D8B3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chmp4bQ9D8B3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chmp4bQ9D8B3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chmp4bQ9D8B3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chmp4bQ9D8B3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chmp4bQ9D8B3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chmp4bQ9D8B3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chmp4bQ9D8B3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Chmp4bQ9D8B3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Chmp4bQ9D8B3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chmp4bQ9D8B3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chmp4bQ9D8B3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chmp4bQ9D8B3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chmp4bQ9D8B3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chmp4bQ9D8B3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Chmp4bQ9D8B3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chmp4bQ9D8B3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chmp4bQ9D8B3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chmp4bQ9D8B3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chmp4bQ9D8B3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chmp4bQ9D8B3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chmp4bQ9D8B3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chmp4bQ9D8B3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chmp4bQ9D8B3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chmp4bQ9D8B3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chmp4bQ9D8B3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chmp4bQ9D8B3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chmp4bQ9D8B3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chmp4bQ9D8B3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chmp4bQ9D8B3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chmp4bQ9D8B3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp4bQ9D8B3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms