Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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Cldn22Q9D7U6 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Cldn22Q9D7U6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Cldn22Q9D7U6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Cldn22Q9D7U6 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Cldn22Q9D7U6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Cldn22Q9D7U6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Cldn22Q9D7U6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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