Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 273 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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