Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms