Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q8

Uncharacterized protein C1orf141 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D5Q8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Q9D5Q8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Q9D5Q8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Q9D5Q8 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Q9D5Q8 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Q9D5Q8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Q9D5Q8 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Q9D5Q8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D5Q8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms