Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms