Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V7

Rabl3, Rab-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl3Q9D4V7 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabl3Q9D4V7 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms