Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tubgcp4Q9D4F8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms