Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms