Protein–RNA interactions for Protein: Q9D479

Uvssa, UV-stimulated scaffold protein A, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UvssaQ9D479 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UvssaQ9D479 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms