Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

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Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Krt20Q9D312 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt20Q9D312 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms