Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H5

Trim42, Tripartite motif-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim42Q9D2H5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim42Q9D2H5 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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