Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramef12Q9D2F1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.3 ms