Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms