Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D1F3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D1F3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D1F3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D1F3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D1F3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D1F3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D1F3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D1F3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D1F3 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D1F3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D1F3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D1F3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D1F3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D1F3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D1F3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D1F3 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D1F3 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms