Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl28Q9D1B9 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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