Protein–RNA interactions for Protein: Q9D131

UPF0686 protein C11orf1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D131 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D131 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D131 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D131 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D131 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D131 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9D131 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Q9D131 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D131 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D131 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D131 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D131 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D131 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D131 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D131 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D131 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D131 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D131 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D131 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D131 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D131 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D131 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D131 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D131 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D131 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D131 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D131 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D131 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D131 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D131 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D131 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D131 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D131 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D131 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D131 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D131 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D131 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D131 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D131 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D131 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D131 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D131 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D131 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D131 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D131 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D131 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D131 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9D131 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D131 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D131 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D131 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D131 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D131 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D131 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D131 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D131 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D131 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D131 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D131 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D131 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D131 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D131 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D131 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D131 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D131 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D131 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D131 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D131 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D131 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D131 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D131 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D131 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D131 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D131 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D131 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D131 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D131 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D131 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D131 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D131 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D131 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D131 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D131 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D131 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D131 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D131 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D131 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D131 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D131 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D131 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D131 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D131 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D131 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D131 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D131 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D131 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D131 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D131 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D131 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D131 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms