Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms