Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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