Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms