Protein–RNA interactions for Protein: Q9D083

Spc24, Kinetochore protein Spc24, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spc24Q9D083 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spc24Q9D083 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms