Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms