Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ssu72Q9CY97 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssu72Q9CY97 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ssu72Q9CY97 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ssu72Q9CY97 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssu72Q9CY97 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssu72Q9CY97 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssu72Q9CY97 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssu72Q9CY97 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ssu72Q9CY97 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ssu72Q9CY97 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssu72Q9CY97 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssu72Q9CY97 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssu72Q9CY97 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssu72Q9CY97 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ssu72Q9CY97 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssu72Q9CY97 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssu72Q9CY97 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ssu72Q9CY97 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssu72Q9CY97 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ssu72Q9CY97 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssu72Q9CY97 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ssu72Q9CY97 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ssu72Q9CY97 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssu72Q9CY97 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssu72Q9CY97 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ssu72Q9CY97 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ssu72Q9CY97 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssu72Q9CY97 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssu72Q9CY97 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms