Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2fQ9CY34 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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