Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mis12Q9CY25 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mis12Q9CY25 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mis12Q9CY25 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mis12Q9CY25 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mis12Q9CY25 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mis12Q9CY25 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mis12Q9CY25 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mis12Q9CY25 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mis12Q9CY25 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mis12Q9CY25 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mis12Q9CY25 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mis12Q9CY25 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mis12Q9CY25 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mis12Q9CY25 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mis12Q9CY25 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mis12Q9CY25 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mis12Q9CY25 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mis12Q9CY25 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mis12Q9CY25 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mis12Q9CY25 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mis12Q9CY25 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mis12Q9CY25 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mis12Q9CY25 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mis12Q9CY25 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mis12Q9CY25 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mis12Q9CY25 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mis12Q9CY25 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mis12Q9CY25 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mis12Q9CY25 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mis12Q9CY25 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mis12Q9CY25 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mis12Q9CY25 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mis12Q9CY25 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mis12Q9CY25 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mis12Q9CY25 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mis12Q9CY25 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mis12Q9CY25 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mis12Q9CY25 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mis12Q9CY25 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mis12Q9CY25 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mis12Q9CY25 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mis12Q9CY25 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Mis12Q9CY25 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mis12Q9CY25 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mis12Q9CY25 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mis12Q9CY25 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mis12Q9CY25 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mis12Q9CY25 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mis12Q9CY25 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mis12Q9CY25 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mis12Q9CY25 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mis12Q9CY25 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mis12Q9CY25 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mis12Q9CY25 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Mis12Q9CY25 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Mis12Q9CY25 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mis12Q9CY25 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mis12Q9CY25 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mis12Q9CY25 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mis12Q9CY25 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mis12Q9CY25 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mis12Q9CY25 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mis12Q9CY25 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mis12Q9CY25 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mis12Q9CY25 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mis12Q9CY25 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mis12Q9CY25 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mis12Q9CY25 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mis12Q9CY25 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mis12Q9CY25 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mis12Q9CY25 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mis12Q9CY25 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mis12Q9CY25 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mis12Q9CY25 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mis12Q9CY25 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mis12Q9CY25 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mis12Q9CY25 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mis12Q9CY25 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mis12Q9CY25 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mis12Q9CY25 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mis12Q9CY25 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mis12Q9CY25 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mis12Q9CY25 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mis12Q9CY25 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Mis12Q9CY25 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mis12Q9CY25 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mis12Q9CY25 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mis12Q9CY25 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mis12Q9CY25 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mis12Q9CY25 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mis12Q9CY25 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mis12Q9CY25 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mis12Q9CY25 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mis12Q9CY25 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mis12Q9CY25 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mis12Q9CY25 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mis12Q9CY25 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mis12Q9CY25 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mis12Q9CY25 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms