Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Exo5Q9CXP9 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Exo5Q9CXP9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Exo5Q9CXP9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Exo5Q9CXP9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Exo5Q9CXP9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Exo5Q9CXP9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Exo5Q9CXP9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Exo5Q9CXP9 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Exo5Q9CXP9 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Exo5Q9CXP9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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Exo5Q9CXP9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Exo5Q9CXP9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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Exo5Q9CXP9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Exo5Q9CXP9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Exo5Q9CXP9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Exo5Q9CXP9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Exo5Q9CXP9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Exo5Q9CXP9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Exo5Q9CXP9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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Exo5Q9CXP9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Exo5Q9CXP9 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Exo5Q9CXP9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Exo5Q9CXP9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Exo5Q9CXP9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Exo5Q9CXP9 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Exo5Q9CXP9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Exo5Q9CXP9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Exo5Q9CXP9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Exo5Q9CXP9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Exo5Q9CXP9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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Exo5Q9CXP9 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Exo5Q9CXP9 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Exo5Q9CXP9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Exo5Q9CXP9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Exo5Q9CXP9 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Exo5Q9CXP9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Exo5Q9CXP9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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