Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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