Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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