Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prkrip1Q9CWV6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms