Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BccipQ9CWI3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
BccipQ9CWI3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
BccipQ9CWI3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BccipQ9CWI3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BccipQ9CWI3 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BccipQ9CWI3 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BccipQ9CWI3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BccipQ9CWI3 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BccipQ9CWI3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BccipQ9CWI3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BccipQ9CWI3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BccipQ9CWI3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BccipQ9CWI3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BccipQ9CWI3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BccipQ9CWI3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BccipQ9CWI3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BccipQ9CWI3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BccipQ9CWI3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BccipQ9CWI3 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BccipQ9CWI3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BccipQ9CWI3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BccipQ9CWI3 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BccipQ9CWI3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms