Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA4

Msmo1, Methylsterol monooxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msmo1Q9CRA4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Msmo1Q9CRA4 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms