Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndufb9Q9CQJ8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndufb9Q9CQJ8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndufb9Q9CQJ8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndufb9Q9CQJ8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndufb9Q9CQJ8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndufb9Q9CQJ8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndufb9Q9CQJ8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndufb9Q9CQJ8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndufb9Q9CQJ8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndufb9Q9CQJ8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndufb9Q9CQJ8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndufb9Q9CQJ8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndufb9Q9CQJ8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndufb9Q9CQJ8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndufb9Q9CQJ8 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndufb9Q9CQJ8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndufb9Q9CQJ8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndufb9Q9CQJ8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndufb9Q9CQJ8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndufb9Q9CQJ8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndufb9Q9CQJ8 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndufb9Q9CQJ8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndufb9Q9CQJ8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufb9Q9CQJ8 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufb9Q9CQJ8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufb9Q9CQJ8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufb9Q9CQJ8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufb9Q9CQJ8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufb9Q9CQJ8 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufb9Q9CQJ8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufb9Q9CQJ8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufb9Q9CQJ8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufb9Q9CQJ8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufb9Q9CQJ8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufb9Q9CQJ8 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufb9Q9CQJ8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufb9Q9CQJ8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufb9Q9CQJ8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufb9Q9CQJ8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufb9Q9CQJ8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufb9Q9CQJ8 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufb9Q9CQJ8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufb9Q9CQJ8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufb9Q9CQJ8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndufb9Q9CQJ8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms