Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Atp6v0e1Q9CQD8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Atp6v0e1Q9CQD8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Atp6v0e1Q9CQD8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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