Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ90

Uncharacterized protein C9orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQ90 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Gm12088-201ENSMUST00000137364 520 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Gm15882-201ENSMUST00000161344 855 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Gm43550-201ENSMUST00000200597 303 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Gm19253-201ENSMUST00000204279 307 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQ90 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQ90 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQ90 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQ90 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Tcrg-V1-201ENSMUST00000103564 374 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQ90 1700023C21Rik-201ENSMUST00000143247 389 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQ90 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Csn2-204ENSMUST00000196869 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQ90 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Spata4-201ENSMUST00000033917 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQ90 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Gm11652-201ENSMUST00000117842 1267 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Gm14525-201ENSMUST00000119649 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Gm22588-201ENSMUST00000157510 140 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Vmn1r224-201ENSMUST00000170076 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQ90 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQ90 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQ90 9330185C12Rik-201ENSMUST00000180837 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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