Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rnaseh2cQ9CQ18 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms