Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPU1

Ssxb1, MCG116417, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb1Q9CPU1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ssxb1Q9CPU1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ssxb1Q9CPU1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ssxb1Q9CPU1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ssxb1Q9CPU1 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ssxb1Q9CPU1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ssxb1Q9CPU1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ssxb1Q9CPU1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ssxb1Q9CPU1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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