Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2ird2Q99NI3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms