Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH8

Trem2, Triggering receptor expressed on myeloid cells 2, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem2Q99NH8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem2Q99NH8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms