Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms