Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hdac9Q99N13 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms