Protein–RNA interactions for Protein: Q99MS8

Tpgs1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpgs1Q99MS8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpgs1Q99MS8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpgs1Q99MS8 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpgs1Q99MS8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpgs1Q99MS8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpgs1Q99MS8 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpgs1Q99MS8 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpgs1Q99MS8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpgs1Q99MS8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpgs1Q99MS8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpgs1Q99MS8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpgs1Q99MS8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpgs1Q99MS8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpgs1Q99MS8 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpgs1Q99MS8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpgs1Q99MS8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpgs1Q99MS8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpgs1Q99MS8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpgs1Q99MS8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpgs1Q99MS8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpgs1Q99MS8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpgs1Q99MS8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpgs1Q99MS8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpgs1Q99MS8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpgs1Q99MS8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpgs1Q99MS8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpgs1Q99MS8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpgs1Q99MS8 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpgs1Q99MS8 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpgs1Q99MS8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpgs1Q99MS8 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpgs1Q99MS8 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpgs1Q99MS8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpgs1Q99MS8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpgs1Q99MS8 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpgs1Q99MS8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpgs1Q99MS8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms