Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SrrtQ99MR6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms