Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH5

Nme5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme5Q99MH5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nme5Q99MH5 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nme5Q99MH5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms