Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtprtQ99M80 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms