Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI9

Clp1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clp1Q99LI9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms