Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms